More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2345 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 246 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 337 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 1037 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  34.04 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 1032 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  32.11 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 320 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 323 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 974 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 358 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  30.56 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  29 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 1562 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.17 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.17 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.1 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  28.92 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.33 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 847 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.65 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  29.61 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  27.73 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.7 
 
 		 642 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 701 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 		 1739 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1039  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0644269  normal  0.0130417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  26.26 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 		 353 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 361 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  27.04 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>