More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4110 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  43.55 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.68 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  42.68 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  45.02 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  42.17 
 
 		 252 aa  218  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  43.67 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  44.49 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  38.06 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  37.75 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  30.92 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 293 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 		 296 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 314 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 349 aa  89  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 273 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 605 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 320 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 390 aa  85.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 316 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  29.51 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.05 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 727 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  30.91 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  36.13 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 974 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.17 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.17 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.94 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.23 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 1037 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.31 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  26.58 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  30.09 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>