More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3029 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0400  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  35.65 
 
 
275 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
302 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  35.98 
 
 
247 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
249 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
247 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  30.29 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
247 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
273 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
264 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  33.48 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
320 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
257 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.19 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  29.19 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  35.42 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 
1032 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.69 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.69 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  30.62 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  24.69 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  24.69 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  40.86 
 
 
1157 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  26.11 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  33.9 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.11 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.46 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  26.67 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.28 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  25.13 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  29.67 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  29.67 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  29.67 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  29.67 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.8 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  30.51 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  39.78 
 
 
1148 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
684 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  34.71 
 
 
1173 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
974 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  29.74 
 
 
731 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  40.66 
 
 
1168 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
1116 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  34.48 
 
 
1014 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  37.25 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  32.29 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
669 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  25.99 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.112255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>