More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0852 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 253 aa  527  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  35.39 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  28.57 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  38.04 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  34.25 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  32.24 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  32.24 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  33.7 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  33.15 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  35.23 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  33.7 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  33.15 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  31.84 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  34.25 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  34.25 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  34.25 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2118  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.690003  normal  0.751692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  34.25 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  32.42 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  31.8 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.8 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  34.07 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.112255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  32.58 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  47.13 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  47.13 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  45.19 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  28.65 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  34.43 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  27.91 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  43.27 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 		 1562 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  29.22 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1039  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0644269  normal  0.0130417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 1037 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 605 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  44.32 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 974 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0675  putative glycosyl transferase  25.81 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  22.4 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0400  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>