211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2118 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2118  HAD family hydrolase  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.690003  normal  0.751692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 302 aa  92  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 320 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  29.3 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  29.3 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  29.3 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  38.04 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  29.67 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  30.28 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  28.84 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  29.63 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.112255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.55 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  31.55 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  27.48 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.91 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  27.72 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  27.06 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  36.67 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  34.83 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  25.23 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0675  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11585  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  35.23 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  34.83 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.79 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 718 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 		 974 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 286 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  30.19 
 
 		 344 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  30.19 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>