More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2563 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  47.46 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  38.43 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 605 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 		 974 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0713  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 1037 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 1562 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0712  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  31.43 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 701 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 718 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  49.47 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  42.34 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  28.1 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  38.66 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.66 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  44.68 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  42.39 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  27.49 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  42.45 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.65 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  43.62 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  43.48 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  27.73 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  35.65 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  27.37 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  21.94 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.66 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 386 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 1301 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>