264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2582 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 		 285 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  35.9 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  37.95 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.48 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  36.87 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  29.2 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 268 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  56.58 
 
 		 320 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  50.55 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 274 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  45.63 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  29.46 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  27.67 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  46.39 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  48 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  46.99 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  50.63 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  42.45 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  48.1 
 
 		 974 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  45.33 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  28.63 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.112255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 		 1562 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  29.69 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  43.82 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  48.68 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  28.82 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  45 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  28.82 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  28.82 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  28.82 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  32.37 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0400  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  52.44 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  28.57 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 		 718 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  39.52 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  28.21 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  29.27 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  29 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  29.84 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  45.45 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2118  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.690003  normal  0.751692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  42.39 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  44.59 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  43.21 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  39.77 
 
 		 1037 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  41.76 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  38.89 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 701 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>