188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0400 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0400  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  32.24 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  29.8 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  24.9 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.9 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  26.02 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1032 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  25.61 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  25.2 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  26.43 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.112255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  25.2 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  25.2 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  26.01 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
1015 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  24.9 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  25.91 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  25.91 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  25.91 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  25.91 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  25.84 
 
 
249 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.09 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  25.45 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
1116 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
348 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
397 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
358 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
403 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.36 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
333 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
256 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
336 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  21.13 
 
 
746 aa  52  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2866  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 
1009 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.715807  hitchhiker  0.00303545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3255  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 
1009 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
357 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  21.62 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  27.13 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
445 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  26.98 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
466 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  22.5 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
450 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
393 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
338 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  27.86 
 
 
323 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  26.89 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  30.56 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3456  hypothetical protein  23.93 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.71 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  30.51 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
544 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>