More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1316 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  64.78 
 
 		 247 aa  334  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  64.37 
 
 		 247 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  56.68 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  48.78 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  43.78 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  41.37 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  45.75 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  40.7 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  36.14 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  34.07 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  32.87 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 293 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.61 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  35.91 
 
 		 296 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 1037 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 		 718 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  34.62 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  38.89 
 
 		 342 aa  98.6  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  33.71 
 
 		 318 aa  98.6  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 293 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 605 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 327 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  30.98 
 
 		 325 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 304 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 335 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  30.77 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  33.92 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13751  hypothetical protein  27.59 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 390 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 974 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 286 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.94 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 581 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.16 
 
 		 326 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.43 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>