More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1007 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  100 
 
 
248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  97.18 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  96.76 
 
 
248 aa  500  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  96.41 
 
 
251 aa  500  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  97.17 
 
 
247 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  96.76 
 
 
248 aa  500  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  97.58 
 
 
248 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  97.18 
 
 
248 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  72.47 
 
 
249 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.112255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 
248 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 
248 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 
248 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 
248 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 
248 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  35.68 
 
 
255 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  34.95 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
252 aa  89  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.77 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  30.51 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
283 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2118  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.690003  normal  0.751692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  44.21 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  46.32 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.97 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  26.56 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0400  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3456  hypothetical protein  28.99 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  43.01 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  28.49 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  28.97 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0675  putative glycosyl transferase  26.76 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
718 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
1037 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 
291 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2017  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588171  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.67 
 
 
2401 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  38.03 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
334 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  36.22 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  25.35 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
704 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  25.78 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.36 
 
 
309 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
266 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
155 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>