More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3180 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
249 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  56.68 
 
 
248 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.85 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  53.44 
 
 
247 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
253 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  44.13 
 
 
245 aa  211  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 
257 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  43.57 
 
 
247 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 
262 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
249 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 
256 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  40.58 
 
 
252 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  41.63 
 
 
258 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  35.12 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  36.25 
 
 
253 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
283 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
284 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
270 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 
260 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
256 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  31.31 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
265 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
302 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
297 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
293 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
296 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
252 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
295 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 
248 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
285 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
264 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
285 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
282 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
605 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
274 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
275 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  32.05 
 
 
262 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
293 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
249 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
269 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  40.65 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.51 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  49.45 
 
 
325 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
269 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1039  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0644269  normal  0.0130417 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
308 aa  95.5  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
1037 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
296 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
337 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
327 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
718 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  34.43 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  41.6 
 
 
342 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
701 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  29.68 
 
 
275 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
974 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.86 
 
 
329 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
316 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
304 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
335 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  41.53 
 
 
302 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
272 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
1035 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  30.56 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
279 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  28.76 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>