More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0250 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  61.54 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  53.28 
 
 
245 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  49.19 
 
 
249 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  45.75 
 
 
257 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.97 
 
 
247 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  42.57 
 
 
247 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  46.75 
 
 
258 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 
252 aa  214  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  40.08 
 
 
249 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
253 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  40.49 
 
 
262 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
258 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  35.92 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
293 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
320 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  39.24 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
269 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
718 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
273 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  36.49 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
295 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 
1037 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
270 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
269 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
283 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  36.53 
 
 
318 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
302 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
296 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
274 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  36.67 
 
 
267 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  35.67 
 
 
325 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
261 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.68 
 
 
248 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
261 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
261 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
285 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
249 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
275 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
296 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
974 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 
324 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.02 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
293 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
282 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  48.86 
 
 
285 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
581 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  31.08 
 
 
342 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  27.57 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
605 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
328 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
286 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
1562 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
320 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  28.04 
 
 
255 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
450 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
327 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
318 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
390 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  25.47 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
663 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
701 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  33.04 
 
 
302 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
746 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>