59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0675 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0675  putative glycosyl transferase  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  33.18 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
253 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  28.8 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.112255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  26.32 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  27.23 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  25.84 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  26.76 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  25.36 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  26.54 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1039  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0644269  normal  0.0130417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  27.83 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2118  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.690003  normal  0.751692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  27.83 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  27.83 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  27.83 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  27.83 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 
248 aa  52  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
235 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  38.2 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
285 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  35.92 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.71 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  26.71 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  25.43 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3456  hypothetical protein  23.43 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  23.46 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  29.55 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
249 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>