More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1112 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  100 
 
 		 1014 aa  2124    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 		 630 aa  328  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0994  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  34.57 
 
 		 759 aa  249  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.624995  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1571  cell wall membrane glycosyltransferase  35 
 
 		 439 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.804132  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  32.63 
 
 		 358 aa  178  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3022  hypothetical protein  28.51 
 
 		 251 aa  126  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 386 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.52 
 
 		 316 aa  122  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5041  hypothetical protein  32.39 
 
 		 299 aa  110  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0995  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.62 
 
 		 281 aa  107  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.215731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.17 
 
 		 317 aa  107  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  26.71 
 
 		 371 aa  103  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  27.6 
 
 		 305 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 307 aa  99.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 335 aa  98.2  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.55 
 
 		 340 aa  97.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 		 340 aa  97.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 		 369 aa  95.9  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.67 
 
 		 616 aa  95.9  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12310  hypothetical protein  28.8 
 
 		 260 aa  95.9  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 341 aa  95.1  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 403 aa  94  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 		 333 aa  92.8  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 		 330 aa  92.8  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 321 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  45.05 
 
 		 316 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1743  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.67 
 
 		 250 aa  91.7  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 302 aa  91.7  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.64 
 
 		 350 aa  91.3  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 		 344 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  38.69 
 
 		 343 aa  90.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 1177 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 1177 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 334 aa  90.1  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.29 
 
 		 1157 aa  89.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 		 324 aa  88.2  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  29.51 
 
 		 301 aa  87.8  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  34.78 
 
 		 326 aa  87.8  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  25.77 
 
 		 315 aa  87.8  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 		 330 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 		 305 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 		 348 aa  87  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2583  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 809 aa  87  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 		 347 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  24.32 
 
 		 347 aa  87  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 351 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 		 337 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 		 309 aa  86.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3780  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1377  hypothetical protein  24.69 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00110436  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 		 341 aa  84  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  32.26 
 
 		 1169 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.64 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 366 aa  83.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  46.08 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.91 
 
 		 729 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.09 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 704 aa  81.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  28.85 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.8 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.8 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  36.8 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.04 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  32.65 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.8 
 
 		 266 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 338 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  32.26 
 
 		 391 aa  80.9  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 		 1015 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 261 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.4 
 
 		 266 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.07 
 
 		 300 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 1032 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 		 329 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 274 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 		 689 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 		 326 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 		 372 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  44.23 
 
 		 276 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 		 329 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  27.62 
 
 		 346 aa  80.1  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  34.92 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.9 
 
 		 340 aa  79.7  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.06 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.04 
 
 		 731 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>