More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2383 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
316 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  84.08 
 
 
320 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  51.9 
 
 
319 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  47.46 
 
 
315 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  43.16 
 
 
334 aa  257  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  43.96 
 
 
338 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 
330 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 
303 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  42.03 
 
 
336 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  44.1 
 
 
363 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  42.64 
 
 
294 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
306 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  40.46 
 
 
287 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
311 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.04 
 
 
306 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 
280 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
295 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
350 aa  99.4  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 
663 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
746 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  36.64 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  41.04 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.86 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  34.19 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
370 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  43.36 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 
336 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 
347 aa  95.9  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
347 aa  95.5  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
703 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 
727 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
358 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
246 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.9 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
329 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  35.77 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
329 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
285 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  41.03 
 
 
338 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.69 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
847 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
365 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  37.19 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3349  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
287 aa  89.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114668  normal  0.646018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  42.24 
 
 
377 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.88 
 
 
321 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
1250 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  41.09 
 
 
450 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
324 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
321 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
1177 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
398 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
1177 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 
338 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 
254 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
364 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
581 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
361 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
373 aa  86.3  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 
1009 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
327 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  36.07 
 
 
255 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  36.07 
 
 
1014 aa  85.1  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.39 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>