More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2079 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2079  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 369 aa  726    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.377907  normal  0.0768803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  39.62 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  45.1 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  42.99 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.39 
 
 		 321 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  43.75 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  47.17 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  45.54 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.5 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.94 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  30.5 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.5 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  42.86 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  28.8 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.51 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  50.5 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.79 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.59 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  24.28 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.02 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.05 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.36 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  26.77 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  26.77 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  29.45 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  26.77 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  29.45 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 233 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  29.45 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 231 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  40.68 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  33.33 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  44.72 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 597 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 1035 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0544  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0412262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2123  CheW protein  25.51 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.266343  normal  0.676158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  39.13 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>