More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1154 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  59.33 
 
 
216 aa  271  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  54.33 
 
 
209 aa  254  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  55.45 
 
 
209 aa  242  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  55.34 
 
 
209 aa  241  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  53.11 
 
 
215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  49.76 
 
 
212 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  74.77 
 
 
134 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1453  glycosyl transferase  74.49 
 
 
101 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.243286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1670  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
219 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
300 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  46.61 
 
 
379 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  47.15 
 
 
310 aa  105  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  45.76 
 
 
302 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
303 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
299 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 
1035 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
333 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.37 
 
 
312 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
289 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 
1015 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 
573 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 
244 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
322 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  43.48 
 
 
341 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 
597 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1851  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.46 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1529  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.322486  normal  0.0695414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
334 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.72 
 
 
321 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
347 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  41.53 
 
 
309 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
318 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
333 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  43.75 
 
 
345 aa  95.1  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 
327 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
317 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  39.09 
 
 
343 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
321 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
337 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
337 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.79 
 
 
326 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
321 aa  92.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 
302 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.86 
 
 
321 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.62 
 
 
341 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
1038 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
309 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
318 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  29.07 
 
 
353 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
898 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  36.88 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
351 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.66 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
337 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
365 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
335 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 
326 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
774 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
898 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
330 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  46.94 
 
 
102 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.04 
 
 
326 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.04 
 
 
326 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
271 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
338 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
347 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
983 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
1250 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
327 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
373 aa  88.6  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
373 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  38.66 
 
 
296 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
249 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
313 aa  88.2  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
324 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
344 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
689 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
352 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.96 
 
 
295 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
777 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
374 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
376 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
305 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
294 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
301 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
326 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
250 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  37.07 
 
 
327 aa  86.3  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
390 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  33.11 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.58 
 
 
326 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
704 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
1032 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
280 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 
276 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>