More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3090 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 310 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.86 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 672 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  43.13 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 597 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 353 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  34.52 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 1015 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  35.94 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 584 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 544 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.55 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.82 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 334 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 336 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 397 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 581 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.36 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.36 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  27.88 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.9 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.74 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 		 367 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 1250 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 235 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.89 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 		 380 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 		 384 aa  93.2  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 280 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 450 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.04 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>