More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1210 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  97.27 
 
 
476 aa  790    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
476 aa  913    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  82.63 
 
 
418 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  45.72 
 
 
354 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  42.77 
 
 
760 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
309 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
337 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 
324 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.28 
 
 
325 aa  133  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  34.23 
 
 
331 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
335 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  32.43 
 
 
341 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
373 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
342 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
306 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
318 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
305 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
318 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
318 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
318 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
336 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  27.2 
 
 
325 aa  99  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
341 aa  97.1  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
305 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
727 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.91 
 
 
321 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
280 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
335 aa  96.3  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
269 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
314 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
322 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
301 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.82 
 
 
272 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
663 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
361 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
384 aa  94.4  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
294 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
333 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  29.39 
 
 
296 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  43.88 
 
 
338 aa  93.2  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  27.4 
 
 
333 aa  93.2  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  32.73 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
316 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.37 
 
 
266 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
581 aa  92.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
252 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
1035 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
351 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
308 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
341 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  34.07 
 
 
338 aa  91.3  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
324 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
318 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
455 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
337 aa  90.9  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
321 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
277 aa  90.9  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.14 
 
 
266 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
958 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
1067 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
325 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
280 aa  90.1  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
280 aa  90.1  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
363 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
342 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.11 
 
 
642 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
334 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.16 
 
 
253 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
308 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
299 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
872 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
341 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
553 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.49 
 
 
340 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
316 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
1177 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
253 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
347 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
1177 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.57 
 
 
329 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
330 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
337 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
289 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
326 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
340 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
247 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  27.78 
 
 
286 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.57 
 
 
329 aa  87.8  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>