More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1783 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  100 
 
 
341 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 
340 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
309 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
760 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  35.67 
 
 
331 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
324 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
342 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
325 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.82 
 
 
329 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 
329 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  29.21 
 
 
338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
341 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
1035 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
335 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
418 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
476 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
337 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
344 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
338 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
351 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
324 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
384 aa  93.2  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
335 aa  92.4  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.68 
 
 
312 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.81 
 
 
941 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  32.74 
 
 
672 aa  89.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  20.96 
 
 
348 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  33.13 
 
 
333 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  33.02 
 
 
785 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  49.47 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.17 
 
 
946 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  42.74 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
727 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
358 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.88 
 
 
637 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
299 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
254 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
326 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.52 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.07 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  26.73 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  24.92 
 
 
1157 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  30.29 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.63 
 
 
328 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  29.17 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.94 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
597 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
704 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.73 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
573 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.73 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
573 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.73 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.73 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  33.65 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  22.73 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  41.6 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.13 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  33.02 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  46.08 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  26.46 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  28.28 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2178  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.06 
 
 
952 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0716  putative sugar transferase  24.27 
 
 
448 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>