More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2552 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  99.37 
 
 		 318 aa  620  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  83.96 
 
 		 318 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  48.1 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  48.48 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  53.11 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4601  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 760 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.24 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  33.78 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 354 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  37.56 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 476 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.56 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  41.24 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 597 aa  72.8  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 455 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  39.39 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  26.82 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.89 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3759  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  46.02 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  47.52 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.99 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 983 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  43.62 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.92 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.76 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.23 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  27.22 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 1250 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.05 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 1035 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  41.76 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  40.59 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2495  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  26.81 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>