More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4948 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 342 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  61.82 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  51.59 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  50.99 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  48.1 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  48.1 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4601  glycosyl transferase family protein  49.06 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 760 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  32.68 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 418 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 689 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  42.86 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.96 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.59 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.59 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.59 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.33 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.59 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 518 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.1 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  29.39 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 727 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 1250 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  29.15 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 672 aa  69.7  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  44.34 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  22.73 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0676  teichuronic acid biosynthesis  24.42 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00829519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  27.62 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.25 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3759  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  41 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  40.95 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 		 581 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 244 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 1035 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  25.93 
 
 		 1157 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  24.75 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  31.6 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  40.2 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  37 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.02 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.02 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  33.02 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.02 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>