More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5934 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 		 338 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  61.82 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  50.15 
 
 		 337 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  49.7 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  48.48 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  48.48 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4601  glycosyl transferase family protein  47.26 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  31.85 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 760 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  33.45 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 418 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  33.05 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  35.62 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 637 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 597 aa  69.3  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  38.54 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3759  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  26.7 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 727 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.76 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.19 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.22 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.22 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  43.62 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1362  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  24.22 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  44.21 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  24.22 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.62 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  40 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0676  teichuronic acid biosynthesis  28.07 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00829519  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  25.55 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.17 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.76 
 
 		 1099 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 1035 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 1301 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.81 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  24.47 
 
 		 1157 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>