More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4246 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 354 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  36.24 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  45.41 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  32.65 
 
 		 349 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  44.66 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4552  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4544  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  42.13 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0400  glycosyl transferase family 2  34.28 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 		 294 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0416  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.6 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3627  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4102  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 303 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  48.04 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 393 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 597 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  43.14 
 
 		 300 aa  86.3  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0668  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 		 974 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0591  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.83 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  40.19 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 		 746 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 1035 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  44.33 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  43.88 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 1562 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  40.95 
 
 		 872 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  40 
 
 		 1115 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  40 
 
 		 1119 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.62 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 		 1115 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  43.69 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 		 1115 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.66 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.37 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  40.38 
 
 		 1099 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 581 aa  79.3  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  42.27 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  40 
 
 		 927 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.84 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0352  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  37.72 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  34.51 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  36.84 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  39.05 
 
 		 1115 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  39.05 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  45.92 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.21 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  45.83 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.57 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  37.62 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 1177 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 1177 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>