More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3627 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4102  glycosyl transferase family protein  95.99 
 
 
349 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3627  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
379 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  81.36 
 
 
355 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  52.91 
 
 
336 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  51.17 
 
 
334 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  37.38 
 
 
368 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 
354 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
316 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
294 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
294 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0416  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
342 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0400  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
329 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  33.83 
 
 
349 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4552  cyclic nucleotide-binding protein  34.4 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
317 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  45.65 
 
 
268 aa  86.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4544  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
1035 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  45.83 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  41.76 
 
 
746 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 
544 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0591  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  42.39 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  40.77 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
581 aa  72.8  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
289 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0352  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
253 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0668  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  29.48 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  40.57 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
597 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  29.19 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  31.13 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  43.18 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.71 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  43.9 
 
 
663 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
1177 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
1177 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  36.27 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.59 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1156 aa  66.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  43.27 
 
 
1157 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
847 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 
230 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.21 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
234 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  39.08 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  38.37 
 
 
300 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0031  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 
636 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.188799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
1739 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  28.51 
 
 
355 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
777 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
953 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>