More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0416 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0416  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
342 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  54.38 
 
 
368 aa  325  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0400  glycosyl transferase family 2  53.96 
 
 
329 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  38.05 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
336 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 
330 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4552  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 
366 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4544  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
364 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
355 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3627  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
379 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4102  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
349 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
316 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
294 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
294 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 
337 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
1035 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 
289 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  39.52 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.17 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  43.62 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.68 
 
 
466 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 
672 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  45.56 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  39.78 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  40.2 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  44.32 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  45.56 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
254 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0591  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  40.62 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  36.63 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  36.63 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  44.21 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  36.63 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  36.63 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.83 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  36.63 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  36.63 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  35.64 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
746 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0352  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
390 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
701 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
1177 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
1177 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  40.86 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  35 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  43.4 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
689 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  34 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  42.55 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  27.2 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
718 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>