More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3254 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
359 aa  734    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
330 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  33.04 
 
 
368 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
316 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
294 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
294 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0400  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0416  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  28.18 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
316 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.38 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.38 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
280 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
336 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
1562 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  25.82 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.89 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  28.99 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.96 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
1035 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
271 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.29 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.89 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
544 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
348 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
974 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
317 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
364 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
390 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
296 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
288 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  33.33 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
247 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
605 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  24.66 
 
 
332 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4544  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  32.77 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.95 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
268 aa  61.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
308 aa  60.8  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
254 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  22.57 
 
 
237 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
701 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.71 
 
 
1157 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
341 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
234 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
332 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  38.71 
 
 
306 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30 
 
 
255 aa  59.3  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
756 aa  59.3  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>