More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1971 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
418 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  82.88 
 
 
476 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  82.63 
 
 
476 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  45.29 
 
 
354 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 
760 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
337 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
309 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 
340 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
335 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 
324 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 
325 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  34.25 
 
 
331 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  32.74 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
344 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
341 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
249 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
333 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 
318 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
250 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
663 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
323 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.07 
 
 
272 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
269 aa  99.8  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
372 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
322 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  38.74 
 
 
329 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  26.38 
 
 
325 aa  97.1  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
672 aa  97.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
305 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.53 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
247 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
1035 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.2 
 
 
266 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.82 
 
 
266 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.2 
 
 
266 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  42.2 
 
 
266 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
336 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
249 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
316 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
316 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
252 aa  93.6  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
308 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
350 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.84 
 
 
266 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  43.88 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
351 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
334 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
244 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
327 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
336 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
280 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.37 
 
 
266 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
301 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.19 
 
 
321 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
337 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.4 
 
 
326 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  26.96 
 
 
295 aa  90.1  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
361 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
280 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
306 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  37.72 
 
 
321 aa  89.7  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
309 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  28.28 
 
 
349 aa  89.7  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
289 aa  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
958 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  35.23 
 
 
338 aa  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
327 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 
327 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
310 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  26.69 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 
350 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.35 
 
 
466 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
872 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  44.04 
 
 
324 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
581 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
277 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
261 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  26.69 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
322 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>