More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  100 
 
 
354 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3721  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2536  glycosyl transferase family 2  48.21 
 
 
339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.157412  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1726  glycosyl transferase family 2  47.48 
 
 
340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0203059  normal  0.147917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06300  glycosyl transferase  45.7 
 
 
340 aa  325  5e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0269612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0648  glycosyl transferase family 2  44.81 
 
 
344 aa  316  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000609844  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12250  glycosyl transferase  43.95 
 
 
342 aa  312  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1239  cell wall membrane glycosyltransferase  41.84 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
369 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.06 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1145  glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 
342 aa  99  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122367  hitchhiker  0.000000285073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  39.85 
 
 
366 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.76 
 
 
1168 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  48.04 
 
 
1032 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.47 
 
 
1157 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
1116 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 
637 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  39.81 
 
 
325 aa  89  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  46.39 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0431  putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC  36.62 
 
 
1636 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  33.16 
 
 
1169 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.28 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.63 
 
 
616 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  36.57 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  42.24 
 
 
1148 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0098  glycosyltransferase-like protein  26.42 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000850354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.02 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
597 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  34.74 
 
 
785 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  38.6 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  25.94 
 
 
326 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.32 
 
 
731 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.99 
 
 
729 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.12 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  29.08 
 
 
1173 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
553 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  29.17 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  36.36 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  34.71 
 
 
697 aa  79.7  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  37.86 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1193  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
871 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  42.55 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.65 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.76 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  39.45 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.92 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  27.82 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  43.69 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  27.82 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.73 
 
 
970 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 
847 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  27.82 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  43.62 
 
 
333 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  25.56 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1480  putative glycosyltransferase  30.77 
 
 
327 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  27.44 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.61 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.19 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  27.82 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.16 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.32 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.67 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  26.46 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.27 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  36.27 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.27 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  36.7 
 
 
708 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
289 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.27 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
684 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  38.93 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>