More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1970 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
318 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  83.96 
 
 
318 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  83.65 
 
 
318 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  51.59 
 
 
342 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  49.7 
 
 
338 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  56.95 
 
 
337 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4601  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
337 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
760 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
325 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
324 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
354 aa  99.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  32.67 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  33.33 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
344 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 
418 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
476 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
727 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 
672 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  26.1 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  47.87 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  35 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
689 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  47 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  45.92 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  27.58 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  39.18 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  39.34 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  40 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  24.11 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.91 
 
 
637 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
704 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.23 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
1250 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  25.48 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
609 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  41.76 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3759  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
597 aa  63.5  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
247 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
366 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
750 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
983 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1015 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0081  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
605 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  25.62 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.76 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  39.36 
 
 
927 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
146 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>