More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2495 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2495  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
325 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 
322 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13951  putative glycosyl transferase  26.71 
 
 
313 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.759655  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13931  glycosyl transferase  26.92 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.771267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
330 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
672 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
310 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
597 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.11 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  34.35 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  34.35 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
455 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  29.59 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  40.41 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.27 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
1035 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.67 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.08 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  26.46 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
727 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  43.27 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  39.42 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.17 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.5 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>