More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3095 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
320 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  83.54 
 
 
316 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  49.83 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  42.01 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  51.07 
 
 
319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  41.21 
 
 
338 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 
330 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 
336 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
363 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
296 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
300 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 
311 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  41.09 
 
 
294 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  32.52 
 
 
306 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
370 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
305 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
663 aa  95.9  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  38.28 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
285 aa  94.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  46.73 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  37.12 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
347 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3349  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114668  normal  0.646018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
746 aa  92.4  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
324 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
329 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
364 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
329 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
246 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  41.22 
 
 
1009 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
280 aa  89.4  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  39.85 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  36.07 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
303 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  38.93 
 
 
727 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
703 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
261 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.07 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.54 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38.17 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
847 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
1250 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
581 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  32.08 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 
450 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  36.5 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.58 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  32.11 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  35.4 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.92 
 
 
1221 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  32.58 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  35.11 
 
 
697 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>