More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1179 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 308 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 1035 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.64 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.04 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  29.91 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 1032 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.8 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  41.07 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  28.43 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  38.83 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  39.58 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  34.45 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  35.4 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.92 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.11 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.08 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.33 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.08 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  34.55 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 704 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  39.42 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 930 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  36.45 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.62 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  28.8 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.35 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.22 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.43 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  38.95 
 
 		 102 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 581 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>