More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0938 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 317 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 584 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 672 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 		 398 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  47.87 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.87 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  51.58 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 379 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 233 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  46.74 
 
 		 235 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.59 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  45.65 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  42.28 
 
 		 306 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 597 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  43.56 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  47.37 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  47.87 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 1035 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  42.4 
 
 		 704 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 380 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 581 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 		 224 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  43.48 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 276 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.94 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  48.96 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.07 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  48.42 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.09 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  44.35 
 
 		 785 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  38.14 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.34 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  42.24 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.66 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  38.38 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.21 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 1015 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  44.57 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.29 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.85 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>