More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1484 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1484  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
257 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
307 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
246 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
302 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  48.91 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.95 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.71 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  40.95 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.93 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  31.47 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  31.17 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
750 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
333 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  49.51 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
1156 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  28.03 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.51 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  28.03 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  40 
 
 
102 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  25.53 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
853 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  51.67 
 
 
746 aa  66.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  31.85 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  27.2 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  29.05 
 
 
354 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
703 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
325 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
1177 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  33.05 
 
 
697 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  33.61 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
1177 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
334 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.83 
 
 
853 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
329 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
342 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
336 aa  62  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
853 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
851 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
851 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
851 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.71 
 
 
851 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  27.27 
 
 
851 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  56.67 
 
 
847 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
303 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
581 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  41.05 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  37.36 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  32.09 
 
 
309 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
376 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  27.31 
 
 
329 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  22.54 
 
 
423 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
596 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
455 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
330 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  29.2 
 
 
353 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>