More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1567 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 363 aa  742    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  73.06 
 
 		 336 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  42.4 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  41.29 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  32.76 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  42.79 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  42.6 
 
 		 296 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  36.24 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 285 aa  87.8  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 		 847 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 		 812 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  27.06 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  28.25 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3349  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114668  normal  0.646018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  33.07 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  36.04 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.69 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 663 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  34.78 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  25.7 
 
 		 1221 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  30.83 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2557  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.74 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  34.91 
 
 		 697 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.79 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.97 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0842  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.752789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.46 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>