273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2011 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  46.46 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  45.64 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  42.93 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 1523 aa  141  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  46.05 
 
 		 1523 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 457 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  39.49 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  39.49 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  39.49 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  39.49 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  39.49 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  39.49 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  40.13 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  40.24 
 
 		 1340 aa  124  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  40.76 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  42.04 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  41.89 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  39.49 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  38.22 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 		 1162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 681 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  37.25 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 785 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  40.36 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 		 996 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 1312 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 1314 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 581 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  31.48 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 		 1287 aa  88.2  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 1256 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  33.11 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  30.95 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  34.07 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 746 aa  68.6  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.67 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.46 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.04 
 
 		 318 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  26.55 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.09 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  23.03 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  27.1 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  24.61 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  26.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  25.67 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  23.72 
 
 		 358 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 336 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  29.33 
 
 		 308 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.3 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.61 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 323 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  34 
 
 		 323 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 332 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  23.26 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.66 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.64 
 
 		 323 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  30.84 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.07 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 303 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  24.4 
 
 		 303 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  23.27 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  26.92 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  24.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  23.42 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.17 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  24.24 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  41.56 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  29 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  23.49 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  26.97 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>