113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3006 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  100 
 
 		 681 aa  1415    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  39.04 
 
 		 229 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  38.5 
 
 		 229 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  39.04 
 
 		 229 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  37.97 
 
 		 229 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 		 1340 aa  137  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  37.91 
 
 		 229 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  38.46 
 
 		 229 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  37.36 
 
 		 229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  37.36 
 
 		 229 aa  132  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  37.36 
 
 		 229 aa  132  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  37.36 
 
 		 229 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  37.57 
 
 		 228 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 1162 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 		 1523 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 229 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 		 1523 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  35.8 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 219 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  34.29 
 
 		 215 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 		 996 aa  105  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 217 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  35.93 
 
 		 216 aa  98.6  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  30.9 
 
 		 231 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 581 aa  95.1  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  95.1  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 1312 aa  94.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 785 aa  88.6  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  29.14 
 
 		 353 aa  88.6  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 229 aa  87.8  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 1314 aa  87.8  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  25.98 
 
 		 249 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 1287 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  33.53 
 
 		 222 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  33.53 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  27.44 
 
 		 247 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 		 1256 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  25.9 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  24.4 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 266 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 298 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2882  hypothetical protein  26.84 
 
 		 223 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  20.77 
 
 		 213 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.86 
 
 		 306 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  30 
 
 		 242 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  25 
 
 		 201 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 415 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 194 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 346 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 330 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 210 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  23.92 
 
 		 219 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 291 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5826  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.790939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 353 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.61 
 
 		 353 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 231 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  21.57 
 
 		 335 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  23.81 
 
 		 238 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 354 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1240  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.8 
 
 		 362 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0688232  normal  0.839739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0139  hypothetical protein  18.32 
 
 		 605 aa  48.1  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000152944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 237 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 252 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  21.16 
 
 		 306 aa  47.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 293 aa  47.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  26.35 
 
 		 231 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.46 
 
 		 345 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  22.64 
 
 		 310 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 235 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  25.24 
 
 		 300 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 274 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6585  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 366 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  33.02 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.42 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  27.27 
 
 		 222 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  22.12 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  21.03 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  29.82 
 
 		 348 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 283 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 283 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  23.08 
 
 		 256 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  23.13 
 
 		 298 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  19.05 
 
 		 504 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 289 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 267 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  18.71 
 
 		 268 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  25.83 
 
 		 245 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>