More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1388 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 324 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.12 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 705 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  31.37 
 
 		 652 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.89 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 		 714 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.59 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 		 318 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.59 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  25.37 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.12 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.97 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.73 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 679 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 624 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1340 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  29.52 
 
 		 884 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  28.18 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  30.6 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 361 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 1359 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 525 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.6 
 
 		 1644 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.6 
 
 		 1644 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 1739 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  28.67 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 841 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 616 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 272 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.95 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>