More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3032 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
714 aa  1449    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 
334 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 
340 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  47.57 
 
 
313 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
329 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
317 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
312 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
311 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 
324 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
324 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
310 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
334 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
387 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
324 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
305 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
324 aa  144  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
298 aa  144  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
705 aa  143  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
333 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  31.02 
 
 
652 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
336 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
293 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
313 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
289 aa  140  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.47 
 
 
355 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
294 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.47 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  32.88 
 
 
369 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  32.7 
 
 
369 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
324 aa  131  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  30.33 
 
 
379 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
334 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  32.3 
 
 
389 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  30.51 
 
 
410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
299 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  31.4 
 
 
391 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
308 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
311 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
303 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
361 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  32.35 
 
 
408 aa  127  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
306 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
340 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
679 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  31.47 
 
 
411 aa  124  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
317 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
318 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  30.45 
 
 
339 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
318 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  33.71 
 
 
350 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  30.69 
 
 
391 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  33.04 
 
 
373 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.44 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
318 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  32.78 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  32.88 
 
 
402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.74 
 
 
318 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
318 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
299 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
624 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
306 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.67 
 
 
2401 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
314 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
1340 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  30.2 
 
 
301 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
307 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
290 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
327 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
703 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
304 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
310 aa  108  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
308 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  31.53 
 
 
368 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
319 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
318 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
306 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
308 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
319 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
308 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
994 aa  104  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
310 aa  103  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
401 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  32.23 
 
 
367 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
360 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  34.48 
 
 
416 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
303 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
282 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
1106 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  27.54 
 
 
377 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  30.65 
 
 
283 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
1152 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
892 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  27.27 
 
 
260 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
334 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
902 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3898  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
298 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
318 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
312 aa  98.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
824 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
683 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>