More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0858 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3898  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
333 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
312 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
310 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
293 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
289 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
294 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
324 aa  119  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
317 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
340 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
305 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
714 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  31.49 
 
 
652 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
705 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
310 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
334 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
303 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
299 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  45.32 
 
 
260 aa  106  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
306 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
303 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
313 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
311 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
300 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
334 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
282 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
308 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
329 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
306 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3552  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
335 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139728  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
318 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.47 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
327 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
387 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
334 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.48 
 
 
318 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
290 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
318 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
525 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
401 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
994 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  54.44 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  23.59 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
340 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
1739 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
703 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
341 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  27.54 
 
 
274 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  28.22 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.58 
 
 
1119 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2722  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  38.17 
 
 
1340 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>