More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3898 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3898  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
298 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  37.67 
 
 
301 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
298 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
313 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
311 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.11 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  32.47 
 
 
652 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
306 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
714 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
282 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
324 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
289 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
705 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
333 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
303 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
298 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
324 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
294 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
307 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
300 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
288 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
302 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
303 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
327 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
360 aa  99.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.6 
 
 
355 aa  96.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
892 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
387 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
346 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 
379 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
324 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
334 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.72 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
340 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
703 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
1152 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
324 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  28.14 
 
 
860 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
369 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
824 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.05 
 
 
838 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
322 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  27.53 
 
 
320 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
361 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
415 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.97 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
616 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
1523 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
705 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
1267 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  26.18 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  28.76 
 
 
1837 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>