More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2348 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  100 
 
 		 1837 aa  3596    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 		 1152 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 824 aa  462  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 		 892 aa  449  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  39.94 
 
 		 1075 aa  403  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 		 683 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  41.86 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  42 
 
 		 691 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  41.71 
 
 		 691 aa  370  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 		 995 aa  321  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 703 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 1340 aa  261  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 994 aa  261  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  30.68 
 
 		 860 aa  259  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 902 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  33.85 
 
 		 700 aa  230  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 1106 aa  229  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 828 aa  183  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 828 aa  180  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 833 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 828 aa  170  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.83 
 
 		 589 aa  169  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 833 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 633 aa  165  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 		 1077 aa  163  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.11 
 
 		 589 aa  162  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.5 
 
 		 585 aa  160  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 		 1739 aa  159  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 878 aa  158  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  32.79 
 
 		 1221 aa  157  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 732 aa  155  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 754 aa  152  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  32.16 
 
 		 596 aa  153  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  25.84 
 
 		 1415 aa  152  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.49 
 
 		 699 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 1106 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 734 aa  150  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 1106 aa  150  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 789 aa  149  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 667 aa  149  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 789 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1714 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.92 
 
 		 810 aa  143  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 633 aa  141  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 909 aa  140  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 796 aa  138  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.75 
 
 		 715 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.17 
 
 		 739 aa  136  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 776 aa  135  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  36.03 
 
 		 2401 aa  135  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.12 
 
 		 921 aa  135  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 713 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 700 aa  132  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 727 aa  130  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  21.02 
 
 		 816 aa  130  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 708 aa  130  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 824 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 598 aa  129  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 		 790 aa  128  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  28.89 
 
 		 637 aa  128  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 793 aa  128  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 529 aa  128  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 822 aa  127  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 750 aa  127  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 619 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 739 aa  123  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 334 aa  123  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 290 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 557 aa  122  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.85 
 
 		 790 aa  122  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 679 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 733 aa  121  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.87 
 
 		 740 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 693 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 324 aa  120  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 627 aa  120  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 626 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.82 
 
 		 739 aa  119  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 340 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 3560 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 776 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 401 aa  117  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  25.47 
 
 		 776 aa  116  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  25.47 
 
 		 776 aa  116  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  25.47 
 
 		 776 aa  116  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  25.47 
 
 		 821 aa  116  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  28.26 
 
 		 588 aa  116  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  30.03 
 
 		 566 aa  116  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 718 aa  116  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 785 aa  115  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 717 aa  115  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 4079 aa  115  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  40.69 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  25.65 
 
 		 821 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 968 aa  114  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 337 aa  112  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 882 aa  112  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 717 aa  112  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 624 aa  112  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  34.31 
 
 		 838 aa  111  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>