More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3709 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 307 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  45.55 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  49.82 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  45.52 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  32.59 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.28 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  29.82 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 841 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.35 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.55 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.39 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  28.43 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  29.58 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.97 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.85 
 
 		 838 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.94 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 401 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 836 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 722 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  28.99 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29.25 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 703 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  28.74 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 415 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 350 aa  99  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  23.86 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 330 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 1267 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  23.39 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>