More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3033 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
308 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
298 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
314 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
305 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
300 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
303 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
344 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
311 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
321 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
288 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
297 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.4 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
324 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
346 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  29.69 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
302 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.51 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  30.71 
 
 
311 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
342 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 
347 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
346 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
355 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
279 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.04 
 
 
342 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
282 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  24.83 
 
 
342 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.89 
 
 
283 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
300 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
353 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
308 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
311 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
836 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
489 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
332 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
314 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
337 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
307 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
970 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
722 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
335 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
369 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
841 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
360 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.61 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
358 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  23.72 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
334 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
310 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
315 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
345 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.62 
 
 
315 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0721  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315795  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
337 aa  85.5  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  29.96 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
841 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
1523 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
1523 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
822 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>