More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0377 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
314 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  74.92 
 
 
318 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  53.92 
 
 
334 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
308 aa  318  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
299 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
308 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
311 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  41.03 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  40.82 
 
 
306 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
299 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
312 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
311 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
310 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
705 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
306 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
324 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.65 
 
 
652 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
298 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
312 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
298 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
387 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
333 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
324 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
360 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 
303 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
297 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
324 aa  119  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
334 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
310 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  26.49 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
327 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
305 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
318 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.51 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  31.25 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  27.94 
 
 
297 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.27 
 
 
311 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
334 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
334 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
291 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.62 
 
 
286 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
277 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  32.49 
 
 
284 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  31.92 
 
 
288 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
270 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  31.25 
 
 
275 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
341 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  29.28 
 
 
296 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
275 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
288 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
281 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
291 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
298 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
401 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
285 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
314 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
304 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
340 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
327 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
313 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
321 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
308 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.71 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.43 
 
 
358 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  26.17 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
705 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>