More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1949 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
308 aa  634    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  81.37 
 
 
299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  66.56 
 
 
299 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  56.54 
 
 
306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  45.39 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  44.2 
 
 
705 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  38.85 
 
 
652 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
312 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  44.68 
 
 
311 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
311 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 
306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
314 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 
313 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  43.92 
 
 
317 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.03 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
387 aa  172  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
310 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
324 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
334 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 
334 aa  158  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
308 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  31.71 
 
 
297 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
333 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
325 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  31.01 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
340 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.54 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
324 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  31.78 
 
 
296 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
312 aa  142  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
282 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
327 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
324 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
334 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
714 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
313 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.77 
 
 
318 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
318 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
318 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
298 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  31.36 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
342 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  34.7 
 
 
284 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
303 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.76 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
307 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
298 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.77 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
346 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
341 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
342 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
306 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
616 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
346 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
279 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
312 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3898  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
298 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.43 
 
 
338 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  30.29 
 
 
336 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
288 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
312 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
275 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  28 
 
 
301 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  32.13 
 
 
838 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
319 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
307 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
455 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>