More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3552 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3552  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 335 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  29.08 
 
 		 652 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.34 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  30.37 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 705 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 379 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 714 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 387 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  27.14 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  29.06 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 334 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 378 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  31.68 
 
 		 260 aa  86.3  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 1340 aa  85.9  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 282 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 841 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.48 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 824 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3898  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.06 
 
 		 2401 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 841 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.66 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  25.56 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 983 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>