More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1643 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
324 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  55.9 
 
 
330 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  38.86 
 
 
342 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 
340 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
334 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
330 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
298 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
347 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
346 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
344 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  29.94 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  35.71 
 
 
284 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
288 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 
302 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  33.13 
 
 
311 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
321 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5891  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
336 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.46 
 
 
320 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
311 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  34.24 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
308 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  30.56 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
282 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
337 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
489 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
290 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
319 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
327 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
300 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
303 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
722 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.51 
 
 
754 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.76 
 
 
838 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
324 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  30.97 
 
 
302 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
703 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.12 
 
 
338 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
841 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
401 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.39 
 
 
700 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.16 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
970 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
841 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
616 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  27.86 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  26.71 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1467  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0153271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
1267 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
1523 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.8 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>