More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4181 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
297 aa  593  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  59.51 
 
 
291 aa  328  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  58.9 
 
 
296 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  58.9 
 
 
296 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  58.9 
 
 
296 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  60.36 
 
 
301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  61.15 
 
 
310 aa  322  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  55.99 
 
 
307 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  58.91 
 
 
305 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  58.7 
 
 
291 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  58.42 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  58.11 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  52.06 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  53.28 
 
 
326 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 
301 aa  248  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  39.34 
 
 
281 aa  132  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
311 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
314 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.8 
 
 
318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
318 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
324 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 
313 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
282 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
324 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
324 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
325 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
299 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
336 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
312 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
318 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
324 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.3 
 
 
652 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25.26 
 
 
297 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
294 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
306 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
334 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
336 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  25.77 
 
 
339 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  31.62 
 
 
274 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.61 
 
 
297 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  25.38 
 
 
339 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
303 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
307 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
315 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
324 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
401 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.29 
 
 
907 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  25.68 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
705 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
304 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
341 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
988 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
272 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.8 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  33.48 
 
 
884 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
334 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 
379 aa  89  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
337 aa  89  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
1340 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
327 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
289 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
303 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4212  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  30.47 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>